23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6951 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  100 
 
 
107 aa  222  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  86.92 
 
 
120 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  85.05 
 
 
107 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  83.18 
 
 
107 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  83.18 
 
 
107 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  47.71 
 
 
217 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2174  TfoX domain protein  46.08 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.598464  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09460  regulator of competence-specific genes  40.95 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0963603  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0549  TfoX domain-containing protein  33.64 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1817  TfoX domain-containing protein  29.29 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  30.49 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0078  TfoX domain-containing protein  37.66 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  43.86 
 
 
140 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0081  TfoX domain-containing protein  37.66 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  42.37 
 
 
203 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  44.07 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  44.07 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25930  regulator of competence-specific genes  29.81 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.650546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  42.86 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  39.29 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  27.63 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  36.21 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  41.03 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>