21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2174 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2174  TfoX domain protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.598464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  46.08 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  41.18 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  42.45 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  41.18 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  42.16 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  39.6 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25930  regulator of competence-specific genes  42.35 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.650546 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0549  TfoX domain-containing protein  33 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09460  regulator of competence-specific genes  33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0963603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1817  TfoX domain-containing protein  28.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  32.84 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  43.14 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  34.29 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  36.99 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  35.09 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0081  TfoX domain-containing protein  28.09 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0078  TfoX domain-containing protein  28.09 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  36.99 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  33.33 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  35.09 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>