65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0262 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  100 
 
 		 206 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  87.38 
 
 		 203 aa  236  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  95 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  64.36 
 
 		 140 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  54.55 
 
 		 132 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  39.37 
 
 		 171 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  43.24 
 
 		 118 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  42.45 
 
 		 114 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  44.86 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  42.27 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  40.91 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  39.8 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  39.8 
 
 		 106 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  40.21 
 
 		 110 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  37.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  38.74 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  41.75 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  35.83 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  38.61 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  45.35 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  32.93 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  32.93 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  32.61 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  38.04 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  36.96 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  36.97 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  36.96 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  33.64 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  34.58 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  37.76 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  35.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  35.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  35.87 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  33.64 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  35.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  35.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  58.7 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  28.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  37.23 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  28.95 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  35.45 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.71 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  33.7 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  44.07 
 
 		 107 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  32.22 
 
 		 120 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  44.07 
 
 		 107 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  34.04 
 
 		 110 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  44.07 
 
 		 107 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  26.21 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  33.01 
 
 		 128 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  44.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  29.59 
 
 		 152 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  31.91 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  46 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  37.1 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  29.52 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  25.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  25.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  25.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  25.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  25.23 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  24.77 
 
 		 238 aa  42  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>