57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1774 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  57.01 
 
 
118 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  58.49 
 
 
105 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  57.94 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  58.88 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  60.19 
 
 
114 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  57.14 
 
 
111 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  48.04 
 
 
182 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  44.55 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  45.05 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  45.36 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  40.2 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  40.62 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  37.5 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  39.22 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  39.22 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  37.23 
 
 
133 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  40 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  32.22 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  39.78 
 
 
192 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  39.18 
 
 
206 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  37.63 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  33.71 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  37.63 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  36.19 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  41.46 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  36.89 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  37.36 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  32.04 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  28.16 
 
 
196 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  32.99 
 
 
138 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  31.52 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  32.69 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  26.47 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  31.68 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  32.04 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  32.04 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  31.07 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  31.07 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  23.4 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  29.41 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  31.18 
 
 
211 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  31.18 
 
 
211 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  31.18 
 
 
211 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  27.27 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  27.66 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  31.07 
 
 
223 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  27.08 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  28.72 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  27.08 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  27.08 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2207  hypothetical protein  30.1 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  30.61 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  27.08 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  27.08 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  35.48 
 
 
109 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  31.68 
 
 
349 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>