27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1437 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  98.13 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  85.05 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  83.18 
 
 		 107 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  53.21 
 
 		 217 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2174  TfoX domain protein  41.18 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.598464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09460  regulator of competence-specific genes  39.05 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0963603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0549  TfoX domain-containing protein  35.51 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1817  TfoX domain-containing protein  27.27 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  32.84 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  44.07 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  42.37 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0078  TfoX domain-containing protein  36.36 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0081  TfoX domain-containing protein  36.36 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  42.11 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  44.07 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  42.31 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  41.07 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25930  regulator of competence-specific genes  32.38 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.650546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  41.03 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  31.15 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  25.64 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  29.73 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  28.57 
 
 		 195 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  50 
 
 		 120 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>