33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1030 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  100 
 
 		 110 aa  226  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  86.6 
 
 		 111 aa  176  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  81.82 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  40.7 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  37.38 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  30.28 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  30.91 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  35.05 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  34.02 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  28.16 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  32.14 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  34.02 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  35.16 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  32.69 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  28.7 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  30.85 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  30.61 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  25.47 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  25 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  29.81 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  25.66 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  28.7 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  30.1 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  29.13 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  31.88 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  25 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  27.43 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  25.26 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  24.78 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>