35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1245 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  80.73 
 
 		 110 aa  179  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  85.57 
 
 		 111 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  41.67 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  41.86 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  37.11 
 
 		 206 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  36.46 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  35.05 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  35.05 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  35.05 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  30 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  29.57 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  26.21 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  31.91 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  27.35 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  28.57 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  28.26 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  25.66 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  32.99 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  26.73 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  25.74 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  30.69 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  32.91 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  27.36 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  26.13 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  32.91 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  31.63 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  31.37 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  35.48 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  32 
 
 		 238 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  26.67 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>