46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0689 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 86 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  44.71 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  43.96 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  40.7 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  43.59 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  45.95 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  47.89 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  45.33 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  45.33 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  45.07 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  42.05 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  40.86 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  45.83 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  39.08 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  41.46 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  39.51 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  42.22 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  45.21 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  38.71 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  42.67 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  37.08 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  39.77 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  35.56 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  34.21 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  35.8 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  36.99 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  41.18 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  31.76 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  27.47 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  41.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  32 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  36.99 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  33.73 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  35.8 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  29.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  29.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  29.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  29.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  35.8 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  29.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  25.27 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  27.06 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>