45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2526 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  100 
 
 		 109 aa  226  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  45.26 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  45.26 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  45.26 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  43.75 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  41.05 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  45.36 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  41.05 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  36.36 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  40 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  37.74 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  33.64 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  34.58 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  34.58 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  35.05 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  34.95 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  37.89 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  37.65 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  32.08 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  29.9 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  33.64 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  34.74 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  32.22 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  29.7 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  25.77 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  28.7 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  28.57 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  26.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  28.87 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  30.56 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  30.84 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  35.8 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  31.46 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  26.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  26.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  26.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  29.52 
 
 		 209 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  27.88 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  26.67 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  22.92 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  30.84 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  27.36 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  29.67 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  29.67 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>