41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1058 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  226  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  86.24 
 
 		 110 aa  195  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  84.85 
 
 		 109 aa  178  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  41.18 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  38.37 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  34.29 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  32.73 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  31.37 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  33.04 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  34.04 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  30.28 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  31.96 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  31.96 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  32.99 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  29.7 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  28.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  31.96 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  29.31 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  32.65 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  34.07 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  26.72 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  35.29 
 
 		 223 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  28.45 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  34.12 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  34.12 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  25.78 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  29.7 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  29.13 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  34.12 
 
 		 349 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  30.84 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  29.81 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  31.96 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  27.47 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  31.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  33.33 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>