50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4340 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  93.1 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  87.31 
 
 		 349 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  81.25 
 
 		 219 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  81.25 
 
 		 219 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  79.86 
 
 		 223 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  80 
 
 		 133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  65.71 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  64.76 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  64.76 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  64.76 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  64.76 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  64.76 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  45.65 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  45.65 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  40.66 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  41.24 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  38.61 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  38.98 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  39.22 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  34.06 
 
 		 168 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  35.71 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  44.32 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  39.13 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  34.71 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  36.46 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  37.21 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  28.32 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  37.35 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  30 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  34.17 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  28 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  29.9 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  32.26 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  30.93 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  29.63 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  27.93 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  27.93 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  27.93 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  29.89 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  31.76 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  31.07 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  30.43 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  30.43 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  28.74 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  31.31 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  26.67 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  29.55 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  28.46 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  36.45 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>