40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4877 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  100 
 
 		 118 aa  246  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  50.91 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  34.23 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  33.96 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  32.18 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  25.74 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  28.04 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  30.39 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  30.39 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  30.39 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  30.39 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  29.17 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  27.45 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  28.12 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  28.12 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  28.12 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  27.27 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  28.12 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  28.12 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  26.85 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  26.04 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  24.04 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  29.9 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  24.49 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  30.11 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  26.61 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  26.47 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  25 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  25.69 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  25 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  26.44 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2207  hypothetical protein  27.72 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  25.24 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  29.41 
 
 		 349 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  24.73 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  34.94 
 
 		 208 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  25.24 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  24.51 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>