20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2207 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2207  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  31.63 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  31.63 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  30.09 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  28.44 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  27.72 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  27.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.99 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  29.17 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  30.1 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  27.36 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  32.63 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  29.59 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  28.16 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  27.45 
 
 		 132 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  40 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  34.04 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  34.04 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  34.04 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  51.35 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>