59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3457 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  97.31 
 
 		 223 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  67.53 
 
 		 349 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  81.25 
 
 		 145 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  92.44 
 
 		 141 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  83.74 
 
 		 133 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  66.67 
 
 		 122 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  66.67 
 
 		 122 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  67.62 
 
 		 121 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  66.67 
 
 		 122 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  66.67 
 
 		 122 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  46.74 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  46.74 
 
 		 152 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  43.01 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  39.81 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  41.05 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  35.56 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  46.59 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  40.43 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  36.96 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  38.64 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  38.82 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  35.87 
 
 		 120 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  30.39 
 
 		 118 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  43.75 
 
 		 423 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  32.14 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  40 
 
 		 928 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  29.9 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  27.78 
 
 		 118 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  33.33 
 
 		 108 aa  51.6  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  27.78 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  30.86 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  32.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  32.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  32.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  29.67 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  31.45 
 
 		 3392 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  32.04 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  29.24 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  40.43 
 
 		 812 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  29.9 
 
 		 105 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  31.46 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  39.74 
 
 		 3393 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  41.56 
 
 		 489 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  29.89 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  38.89 
 
 		 3486 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  37.25 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  28.72 
 
 		 105 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  40.24 
 
 		 484 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  36.89 
 
 		 3333 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  39.19 
 
 		 444 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  29.17 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  45.45 
 
 		 311 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>