58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1756 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  53.54 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  53.54 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  53.54 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  48.26 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  49.75 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  45.73 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  45.69 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  41.35 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  41.03 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  41.03 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  41.03 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  41.03 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  41.03 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  40.51 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  40.51 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  40.51 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  40.51 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  40.51 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  40.51 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  40.51 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  40.51 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  37.78 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  37.02 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  35.39 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  33.89 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  26.23 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  26.24 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  42.35 
 
 		 114 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  27.22 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  42.19 
 
 		 108 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  36.59 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  41.46 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  35.94 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  25.13 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  37.5 
 
 		 120 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  34.83 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  51.6  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  30.84 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  31.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  28.12 
 
 		 105 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  34.15 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  27.88 
 
 		 109 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  30.48 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  32.91 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  34.18 
 
 		 108 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  32.26 
 
 		 110 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  30.38 
 
 		 91 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  29.9 
 
 		 106 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  29.87 
 
 		 105 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  32.61 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  32.84 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  30.61 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  38.89 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  29.17 
 
 		 138 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>