42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1113 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  75.88 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  75.88 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  75.88 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  75.88 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  75.88 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  75.38 
 
 		 209 aa  323  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  75.38 
 
 		 209 aa  322  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  75.38 
 
 		 209 aa  320  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  59.8 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  45.69 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  44.33 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  72.12 
 
 		 114 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  41.75 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  42.27 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  41.03 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  42.64 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  42.64 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  42.64 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  33.52 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  30.05 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  30.17 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  27.07 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  29.19 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  26.52 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  40.54 
 
 		 108 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  26.39 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  37.04 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  33.73 
 
 		 91 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  23.23 
 
 		 105 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  22.99 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  22.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2250  TfoX domain protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  30.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  22.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>