53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1211 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  100 
 
 
209 aa  426  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  70.71 
 
 
208 aa  297  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  64 
 
 
206 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  63 
 
 
206 aa  266  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  53.54 
 
 
211 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  53.54 
 
 
211 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  53.54 
 
 
211 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  49.75 
 
 
219 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  47.76 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  44.33 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  44.33 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  44.33 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  44.33 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  44.33 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  40.19 
 
 
209 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  40.19 
 
 
209 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  39.23 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  38.12 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  38.67 
 
 
195 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  36.11 
 
 
195 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  30.94 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  39.42 
 
 
114 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  29.24 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  27.47 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  39.02 
 
 
84 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  39.19 
 
 
108 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  28.97 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  23.15 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  37.66 
 
 
126 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  30.61 
 
 
105 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  35.71 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  31.63 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  32.43 
 
 
108 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  39.71 
 
 
133 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  29.52 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  31.17 
 
 
84 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  33.62 
 
 
171 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  32.84 
 
 
131 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  28.12 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  28.12 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  32 
 
 
114 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  35.38 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  35 
 
 
124 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  32.22 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  28.12 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  32.26 
 
 
109 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>