13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09460  regulator of competence-specific genes  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0963603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0549  TfoX domain-containing protein  68.93 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1817  TfoX domain-containing protein  48.48 
 
 		 99 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25930  regulator of competence-specific genes  47.06 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.650546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  40.95 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  39.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  39.05 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  39.05 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  39.05 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0078  TfoX domain-containing protein  44.68 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0081  TfoX domain-containing protein  44.68 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  30.28 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2174  TfoX domain protein  33 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.598464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>