More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4389 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  68.53 
 
 		 243 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  64.96 
 
 		 261 aa  317  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  63.25 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  66.23 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  65.68 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  63.27 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  65.8 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  65.09 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  65.95 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  65.53 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 245 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 245 aa  305  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0595  ribonuclease PH  63.04 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 245 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 245 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  64.1 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  64.1 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2536  ribonuclease PH  62.04 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0273793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  63.79 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  63.79 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 246 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  64.91 
 
 		 232 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  63.95 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 246 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3202  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0193809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  61.8 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  63.68 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2240  ribonuclease PH  60.41 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  61.89 
 
 		 245 aa  298  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  62.66 
 
 		 255 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  61.54 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  64.1 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  62.39 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  61.64 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 237 aa  295  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  62.29 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  63.68 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4325  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  61.6 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 238 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  62.82 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 238 aa  291  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  61.8 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  62.61 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  60.68 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  62.39 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  61.64 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  63.25 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  61.97 
 
 		 239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1951  RNAse PH  61.64 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00113986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1876  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000148347  hitchhiker  0.00450296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 239 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  59.91 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 239 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1031  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  58.55 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  59.05 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  64.53 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  61.54 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>