131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3678 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  59.52 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  58.33 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  56.47 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  56.18 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  57.47 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  58.33 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  55.95 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  54.65 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  56.79 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  56.79 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  54.12 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  51.72 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.75 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  50.67 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  53.52 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  50.68 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  44.58 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  48.15 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  47.95 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  47.95 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  47.95 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  47.95 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  61.54 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  39.77 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  54.1 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  46.58 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  38.27 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  42.39 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.21 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  46.15 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  40.7 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  39.02 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  43.04 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.46 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  41.76 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  41.76 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.59 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.36 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  41.25 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  41.25 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  42.67 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  47.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  49.28 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.27 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  46.97 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  40.23 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.71 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  38.55 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  38.55 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  38.55 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  38.27 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  37.93 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  37.97 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.8 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  39.56 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  37.97 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  34.18 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  38.81 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.91 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  34.18 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  32 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.91 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.76 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  31.71 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  42.03 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  35.9 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  32.05 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  41.77 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.05 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  43.08 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  35.8 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.77 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  38.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  37.68 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  34.15 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  32.91 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  37.78 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  34.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  35.44 
 
 		 275 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  30.49 
 
 		 243 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>