44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1235 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  190  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  54.88 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  44.29 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  46.27 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  43.06 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  35.96 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  44.19 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  41.77 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  43.28 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  40.28 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  44.44 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  31.65 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  41.94 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  41.94 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  34.29 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  38.89 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  40 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  39.06 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  38.81 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  36.84 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.17 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  41.07 
 
 		 93 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  36.11 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  38.81 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  43.08 
 
 		 86 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  37.04 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  47.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  42.11 
 
 		 79 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>