69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16151 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  79.12 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  69.23 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  65.93 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.53 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.74 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  48.68 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  44.3 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  44.3 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  48.05 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  42.05 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  41.98 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  40.48 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  36.47 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  37.97 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  38.27 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  35.71 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  38.55 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  33.77 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.73 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  29.41 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  28.41 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  37.68 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  40.32 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.09 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  39.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  34.07 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  31.34 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  36.47 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  31.25 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  30.23 
 
 		 90 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  38.71 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  41.27 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  39.73 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  34.62 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  24.42 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  38.96 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  29.58 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  44.12 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  43.55 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  35.62 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.94 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  29.58 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  29.58 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  29.58 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  29.58 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0637  hypothetical protein  51.35 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.374734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.21 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  29.58 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  29.73 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  29.58 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  29.58 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  28.17 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  29.58 
 
 		 93 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  34.85 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27.66 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  33.75 
 
 		 226 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>