49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1869 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  184  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  74.71 
 
 
90 aa  147  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  69.41 
 
 
85 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  69.41 
 
 
85 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  66.67 
 
 
84 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  61.73 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  56.79 
 
 
84 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  43.59 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  42.68 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.51 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  37.21 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.03 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.03 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.82 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  35.8 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  39.24 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  32.93 
 
 
93 aa  57  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  35.8 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  35.62 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  34.12 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  37.97 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  32.5 
 
 
89 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.06 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  31.71 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  34.07 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  30.49 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.06 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  35.38 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  31.03 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  34.09 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  29.27 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  33.75 
 
 
218 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  31.4 
 
 
93 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  34.72 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  27.16 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  36.92 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  37.14 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.05 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  39.39 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  37.35 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  32.14 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  32.14 
 
 
197 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  32.84 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  33.78 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  31.11 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>