49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2021 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  52.5 
 
 		 90 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  48.72 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  43.59 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  46.15 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  46.15 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  42.68 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  51.28 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.68 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  45.12 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.77 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.76 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.78 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  30.49 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  32.91 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  29.11 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.95 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  27.85 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  25.32 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  27.63 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  29.11 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  29.11 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  27.85 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  27.38 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  36.62 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  30.77 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  27.03 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  39.51 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  28.38 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  37.31 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  35.62 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  32.89 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.72 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  31.08 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  30.56 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  33.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  25.64 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  33.33 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  35.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  32 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>