42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1024 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 91 aa  189  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  96.7 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  50.55 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  50.55 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.55 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.88 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  41.03 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  36.25 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  35.44 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  34.62 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  31.76 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.49 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  30.51 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  30.23 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  31.08 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  27.27 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.4 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  28.75 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  28.92 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  30.49 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  30.38 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  30.38 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  31.82 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  30.86 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  32.18 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  28.21 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  28.21 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  27.85 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  29.33 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  30.65 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  31.25 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>