61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04141 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  79.12 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  74.73 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  68.13 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.24 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.24 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.46 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  41.77 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  41.77 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  46.84 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  41.46 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  40.48 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  39.19 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  41.25 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  32.22 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  35.8 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  37.35 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  32.47 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  29.55 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  31.82 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  32.5 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.55 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  32.95 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  26.44 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  28.4 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  35.62 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  28.4 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  37.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  33.75 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.25 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  39.68 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.94 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  24.71 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  39.39 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  32.95 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  37.1 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  35.62 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  32.91 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  31.82 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0637  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.374734  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.94 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  38.03 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  29.47 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  29.47 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  29.41 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  36.25 
 
 		 128 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>