101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  46.88 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  44.87 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  46.07 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  50.6 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  46.15 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  47.44 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  47.44 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  47.44 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  46.59 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  46.07 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  48.61 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  37.84 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.68 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.76 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  41.1 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  45.83 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.66 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.68 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  44.58 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  42.05 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  45.83 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  46.48 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  44.71 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  29.55 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  37.35 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.78 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  45.68 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  31.94 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  32.05 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  45.78 
 
 		 524 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  36.11 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  42.25 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  38.27 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.48 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  42.31 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  36.67 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  38.96 
 
 		 205 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  36.76 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  40.54 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  31.76 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  39.77 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  52.73 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  27.16 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  40.48 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  31.71 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  23.6 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  41.54 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.47 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  31.94 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  38.2 
 
 		 275 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  38.2 
 
 		 264 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  41.54 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  48.15 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  30.86 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  38.16 
 
 		 240 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  29.27 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  29.27 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  29.27 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  39.33 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  31.08 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  30.56 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  33.77 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  40.28 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  36.76 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  31.76 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  37.04 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  30.99 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  25.88 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  35.63 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  26.39 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  31.43 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  35.48 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  36.14 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.63 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  44.44 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  36.14 
 
 		 234 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  40 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>