33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1210 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 66 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  55.74 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  59.09 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  56.36 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  56.86 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  50.79 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  50.79 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  50.79 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  52.63 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  56.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  55.77 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.88 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  50.91 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  54.55 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  54 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  58.49 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  63.89 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  40.38 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  53.49 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  54 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  54 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  44.83 
 
 		 524 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  46.88 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  54.55 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  26.53 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  38 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.89 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  36.96 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  52.38 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  45.61 
 
 		 249 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>