85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1509 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  100 
 
 
140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  53.21 
 
 
130 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  58.59 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  49.58 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  59.49 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  54.84 
 
 
128 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  53.26 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  53.26 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  53.26 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  49.49 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  52.38 
 
 
121 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.54 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  51.81 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  51.76 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  60.56 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  58.9 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  59.74 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  59.15 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  60.56 
 
 
524 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.59 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  56.47 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.3 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  38.89 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  52.63 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  52.94 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  51.92 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.88 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  44.19 
 
 
200 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  42.35 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.68 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  44.12 
 
 
247 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  44.12 
 
 
247 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  55.77 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  36.99 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  42.86 
 
 
243 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  53.42 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  38.24 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  36.99 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  36.47 
 
 
240 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  46.58 
 
 
93 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  39.73 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  33.94 
 
 
205 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  40.28 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  37.68 
 
 
203 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  38.81 
 
 
200 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  36.73 
 
 
263 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  34.55 
 
 
231 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  37.68 
 
 
197 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 
89 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  34.67 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  29.29 
 
 
247 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  36.62 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  39.13 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.35 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.82 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  37.5 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  35.82 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  32.91 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  40.91 
 
 
249 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  29.35 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  32.73 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  30.3 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  33.82 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  38.03 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  32.86 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  32.94 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  34.25 
 
 
264 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  37.68 
 
 
246 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  38.24 
 
 
317 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.03 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.67 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  36.23 
 
 
212 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  35.53 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  31.43 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  34.85 
 
 
275 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  42.25 
 
 
215 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  34.88 
 
 
246 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>