127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0924 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  59.52 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  59.26 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  57.47 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  49.45 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  51.16 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  52.87 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  54.88 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  54.55 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  46.59 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  49.41 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  49.41 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  44.94 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  55.13 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.94 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  46.84 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  48.1 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  48.81 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  52.11 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  38.75 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  44.59 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  47.95 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  50.7 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  48.05 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  47.89 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  45.21 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  45.21 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  45.21 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  42.7 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  43.84 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.67 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  49.38 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  47.89 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  39.24 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  44.71 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  35.8 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.5 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  41.11 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  41.11 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  43.53 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  42.65 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  47.69 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  41.25 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.25 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  45.57 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  45.31 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.48 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  40.54 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  44.78 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.35 
 
 		 101 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  38.2 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  41.54 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  39.44 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.05 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  38.46 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.73 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  37.97 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  32.94 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  37.8 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  38.16 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  43.86 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  40.26 
 
 		 275 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  40.7 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  39.08 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.77 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  39.06 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  35.8 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  28.24 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  30.77 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.5 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  33.73 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  37.18 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  36.59 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  38.16 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  33.73 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  40.91 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  39.51 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  39.24 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  35.11 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  39.13 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  37.68 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  27.85 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  34.72 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.59 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  37.68 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  37 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  33.85 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>