51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf786 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  100 
 
 
105 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  38.96 
 
 
96 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  37.66 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  37.66 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.14 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.94 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  28.24 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  37.04 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.14 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.05 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  30.59 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  37.7 
 
 
100 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  36.59 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  29.63 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  32.47 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  34.12 
 
 
92 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  27.38 
 
 
93 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  37.14 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  29.07 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  29.63 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  38.57 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  33.75 
 
 
249 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  38.57 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.33 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  30.23 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  33.77 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  32.43 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  32.43 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  26.39 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  32.5 
 
 
257 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  37.14 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  37.14 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  37.14 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  37.14 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  37.14 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  37.14 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  37.14 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  32.35 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  33.77 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  29.87 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  27.16 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  28.17 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  32.88 
 
 
247 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  29.17 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  32.76 
 
 
240 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>