81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2612 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  86.78 
 
 		 249 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  71.23 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  71.23 
 
 		 247 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  70.75 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  65.47 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  51.56 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  50.52 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  44.6 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  44.86 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  46.77 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  46.27 
 
 		 217 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  44.29 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  45.27 
 
 		 200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  46.39 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  42.58 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  41.33 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  45.37 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  38.34 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  47.42 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  42.35 
 
 		 231 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  41.06 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  42.58 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  43.07 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  41.24 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  40.51 
 
 		 205 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  43.01 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  40.62 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  43.23 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  43.68 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  41.14 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  40.93 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  40.41 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  40.41 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  41.8 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  40.72 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  37.61 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  36.98 
 
 		 194 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.18 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  36.14 
 
 		 203 aa  95.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  39.39 
 
 		 197 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  38.64 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  37.88 
 
 		 205 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  35.96 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  39.06 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  34.93 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  28.35 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  34.62 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  27.38 
 
 		 94 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  27.38 
 
 		 94 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  40.79 
 
 		 317 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  43.55 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  37.68 
 
 		 95 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  25 
 
 		 94 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  25 
 
 		 93 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  26.83 
 
 		 91 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  29.69 
 
 		 93 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  40.26 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  26.44 
 
 		 92 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  32.5 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  24.1 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.32 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  35.82 
 
 		 113 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  41.94 
 
 		 524 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.71 
 
 		 92 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  40.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  39.71 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  40.32 
 
 		 79 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>