107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2924 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  99.6 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  91.14 
 
 		 243 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  71.43 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  63.64 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  71.74 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  49.25 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  47.14 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  47.55 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  46.09 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  42.92 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  44.44 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  46.11 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  41.58 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  44.9 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  42.21 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  46.04 
 
 		 200 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  45.54 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  44.55 
 
 		 200 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  44.72 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  45.93 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  46.41 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  42.93 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  39.09 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  40.4 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  38.86 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  38.64 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  41.48 
 
 		 210 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  36.44 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  41.97 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  39.44 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  39.25 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  33.95 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  38.12 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  34.91 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  38.12 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  38.67 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  38.98 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  32.14 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.44 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.93 
 
 		 197 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  31.98 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  31.37 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  37.69 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  27.84 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  36.64 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  35.03 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  32.26 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  44.78 
 
 		 139 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  36.73 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  40.58 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  44.12 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.78 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  45.31 
 
 		 524 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  42.65 
 
 		 121 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  27.47 
 
 		 92 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  36.76 
 
 		 100 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.74 
 
 		 135 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.18 
 
 		 93 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  27.71 
 
 		 88 aa  48.9  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  39.06 
 
 		 135 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  31.4 
 
 		 93 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  31.88 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  32.84 
 
 		 95 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  26.83 
 
 		 91 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 79 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  22.99 
 
 		 93 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  41.79 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  34.94 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 66 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  42 
 
 		 95 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  35.94 
 
 		 107 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.85 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  27.69 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  28.24 
 
 		 96 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  26.74 
 
 		 88 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  29.69 
 
 		 90 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  31.4 
 
 		 89 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  35.94 
 
 		 104 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  26.74 
 
 		 88 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>