60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3627 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  48.42 
 
 
212 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  46.84 
 
 
221 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  46.88 
 
 
202 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  42.59 
 
 
237 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  44.95 
 
 
210 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  45.83 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  45.83 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  43.5 
 
 
200 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  43.75 
 
 
200 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  43 
 
 
217 aa  141  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  43.63 
 
 
264 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  44.62 
 
 
259 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  42.29 
 
 
221 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  41.41 
 
 
205 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  43.23 
 
 
275 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  41.15 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  40.29 
 
 
240 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  42.08 
 
 
234 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  41.71 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  43 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  44.92 
 
 
194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  41.97 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  39.61 
 
 
234 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  44.44 
 
 
257 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  40.22 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  43.98 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  38.5 
 
 
231 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  34.55 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  39.15 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  42.93 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  38.97 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  45.98 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  42.93 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  37.95 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  38.97 
 
 
230 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  43.35 
 
 
246 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  35.59 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  38.74 
 
 
240 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  35.79 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  42.74 
 
 
205 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  42.73 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  34.94 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  32.14 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  34.94 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  38.68 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  28.5 
 
 
212 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  32.53 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  37.04 
 
 
94 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  37.04 
 
 
94 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  31.33 
 
 
210 aa  52  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  32.1 
 
 
94 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  40 
 
 
95 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  33.82 
 
 
90 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  39.06 
 
 
93 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  31.65 
 
 
103 aa  42.4  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  35.94 
 
 
92 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  38.1 
 
 
96 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  26.72 
 
 
179 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>