107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0039 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  63.24 
 
 
205 aa  259  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  62.56 
 
 
210 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  63.68 
 
 
206 aa  248  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  63.5 
 
 
202 aa  247  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  63 
 
 
202 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  63.94 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  45.64 
 
 
263 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  47.57 
 
 
221 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  42.71 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  44.95 
 
 
227 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  42 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  40.1 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  38.28 
 
 
234 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  38.5 
 
 
246 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  38.38 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  39.2 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  39.23 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  38.46 
 
 
221 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  36.02 
 
 
259 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  34.62 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  41.48 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  38.62 
 
 
200 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  42.86 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  41.48 
 
 
247 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  41.48 
 
 
247 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  36.68 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  36.97 
 
 
221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  38.42 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  35.5 
 
 
211 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  35.82 
 
 
234 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  38.46 
 
 
240 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  34.17 
 
 
231 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  33.82 
 
 
240 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  34.17 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  31.96 
 
 
252 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  37.28 
 
 
211 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  33.51 
 
 
231 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  34.72 
 
 
244 aa  91.7  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  32.32 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  33 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  35.23 
 
 
197 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  31.07 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.71 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.71 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  27.72 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  40.85 
 
 
98 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  35 
 
 
96 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  35 
 
 
96 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  37.66 
 
 
95 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  37.21 
 
 
100 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  37.31 
 
 
90 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  26.32 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  37.31 
 
 
90 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  35.82 
 
 
90 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  32.94 
 
 
95 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  34.02 
 
 
317 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  32.35 
 
 
88 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  36.05 
 
 
98 aa  52  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  38.67 
 
 
113 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  28.57 
 
 
92 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  36.07 
 
 
94 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  31.58 
 
 
103 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  35.82 
 
 
93 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  28.4 
 
 
90 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.89 
 
 
90 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  31.17 
 
 
95 aa  48.1  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  32.84 
 
 
91 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  31.4 
 
 
98 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  30.12 
 
 
89 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  35 
 
 
100 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.52 
 
 
91 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  32.86 
 
 
89 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.88 
 
 
90 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.85 
 
 
93 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  29.35 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.76 
 
 
101 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  33.8 
 
 
104 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.14 
 
 
93 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  30.23 
 
 
108 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.78 
 
 
92 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.19 
 
 
105 aa  42.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  40.32 
 
 
95 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  31.25 
 
 
88 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  35.38 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>