73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0777 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  42.35 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  41.76 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  43.18 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  47.06 
 
 		 524 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.3 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  47.3 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  47.95 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  45.71 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  42.35 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  45.71 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  42.35 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.36 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  36.67 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  52.73 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  37.88 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  45.68 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.67 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  42.62 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.12 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  40.85 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  37.31 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  47.69 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  40.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1101  hypothetical protein  52 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1229  protein of unknown function DUF448  48.15 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  42.19 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  50.91 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  41.18 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  41.18 
 
 		 247 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  39.19 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1161  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  29.58 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  36.23 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  43.21 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  28.17 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  40.85 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  38.24 
 
 		 243 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.36 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  36.23 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  40.85 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  38.89 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  33.8 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  38.6 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  29.07 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  38.24 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  39.39 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  30.99 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  32.1 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  35.38 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  35.14 
 
 		 210 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  41.94 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  29.49 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  35.48 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  32.91 
 
 		 200 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  32.31 
 
 		 197 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  27.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  37.7 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  34.38 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>