97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1369 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  94.55 
 
 		 110 aa  206  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  49.04 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  49.04 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  49.04 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  54.65 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  56.82 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  58.9 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  54.12 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  63.89 
 
 		 524 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  53.33 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  60.56 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  46.22 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  63.24 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  55.68 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  51.76 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  51.52 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.07 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.35 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.71 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.59 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  42.5 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  44.71 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  44.29 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  52.44 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.48 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  38.57 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  37.97 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  38.57 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  42.68 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  37.68 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  34.18 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.33 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  37.63 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  49.09 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.37 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  41.79 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  37.68 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  40.28 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  38.2 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  35.56 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  47.69 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  31.71 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  34.78 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.96 
 
 		 200 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  38.81 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  54.9 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  38.36 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  38.16 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  34.31 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  54 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  40 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  38.37 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  35.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  40.3 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  29.21 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  50.91 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  28.74 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  49.09 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  41.94 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  34.12 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  42.05 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.65 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  44.78 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  39.39 
 
 		 231 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  30.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  41.54 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  41.79 
 
 		 247 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  40.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  41.79 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  28.09 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  41.43 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  48.28 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  37.8 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  33.93 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  32.14 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  30.65 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  47.27 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  37.31 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  29.58 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  29.21 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  36.62 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  29.87 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  37.62 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  38.03 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>