71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0381 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  81.63 
 
 
98 aa  168  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  53.76 
 
 
100 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  52.87 
 
 
96 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  51.72 
 
 
91 aa  104  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  55.17 
 
 
96 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  60.22 
 
 
108 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.54 
 
 
113 aa  100  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.39 
 
 
98 aa  94  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  52.27 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  55.22 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  55.22 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  55.22 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  55.22 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  52.11 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  52.11 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  52.11 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  52.11 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  55.22 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  46.48 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  46.48 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  43.04 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  40.96 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  38.54 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  45.95 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  42.17 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  42.17 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  38.55 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  47.3 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  41.25 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  40.74 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  41.25 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  41.67 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  59.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  39.74 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  36.11 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  52 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  35.37 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.47 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  34.72 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  36 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  37.66 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  32.5 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  35.29 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  43.33 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  29.67 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  35.56 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  31.82 
 
 
194 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  29.17 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  42.65 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  31.87 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  31.4 
 
 
210 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.1 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  26.09 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  27.85 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  45.45 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  31.17 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  29.89 
 
 
197 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  29.89 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.46 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  31.63 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  32.18 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  36.51 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  29.55 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  26.83 
 
 
240 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>