78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0815 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  65.59 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  58.62 
 
 		 91 aa  116  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  60.22 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  54.26 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.42 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  45.74 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  46.43 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  49.47 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  45.98 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  40.62 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.7 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  45.78 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  45.68 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  45.68 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  43.84 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  42.47 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  42.47 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  42.47 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  42.47 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  38.27 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  44 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  38.64 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  33.75 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  36.25 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  34.62 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  41.89 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  35 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  34.57 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  37.04 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  48.98 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  39.24 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  34.83 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  31.25 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  31.31 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  30.43 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  29.87 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  30.95 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  32.58 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  30.23 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  32.61 
 
 		 252 aa  48.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  38 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  33.98 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  30.49 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  36.76 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  36.76 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  29.07 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  27.16 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  28.09 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  28.09 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  31.96 
 
 		 317 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  26.97 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  30.34 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  35.21 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  30.34 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  36.23 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  29.7 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  32.81 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  28.26 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  31.25 
 
 		 249 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  28.36 
 
 		 247 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>