63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0812 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 98 aa  196  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  54.64 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  48.39 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  45.16 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  45.74 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  44.83 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.79 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  42.05 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  49.32 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  45.74 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  45.74 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  49.32 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  49.32 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  49.32 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  43.21 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  41.25 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  45 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  40.96 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  36.78 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.48 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  38.75 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  38.27 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  36.78 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  35.48 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  35.11 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  36.59 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  34.88 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  34.48 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  40.54 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  35.8 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  38.24 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  34.67 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  30.34 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  36 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  42.59 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  47.17 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  35.37 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  36.05 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  27.85 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  27.85 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.85 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  33.33 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  29.21 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  28.26 
 
 		 206 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  29.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  29.07 
 
 		 194 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>