70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl293 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  65 
 
 
95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  45.95 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  46.67 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  41.18 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  45.95 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  47.3 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.8 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  46.27 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  46.27 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  46.27 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  46.38 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  45.71 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  46.27 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  46.27 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  46.27 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  46.27 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  41.25 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  41.25 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  34.83 
 
 
221 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  42.65 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  40.51 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  36.59 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.8 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  35.06 
 
 
212 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  36.25 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  33.77 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  38.46 
 
 
206 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  41.1 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.19 
 
 
113 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  31.94 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  35.82 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  36.76 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  34.18 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  41.89 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  36.76 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  32.94 
 
 
240 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  31.46 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  31.17 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  33.8 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  30.99 
 
 
211 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  37.88 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.62 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 
234 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  34.85 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  34.85 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.85 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  29.63 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  29.07 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  37.33 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  30.77 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  38.89 
 
 
247 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  31.08 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  35.82 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  30.38 
 
 
264 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  31.65 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  29.11 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  35 
 
 
84 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  37.31 
 
 
230 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  27.69 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  27.69 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  32.5 
 
 
212 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>