97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0875 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  215  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  96.15 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  44.94 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.3 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  39.77 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  43.04 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  40.24 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  42.67 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  43.04 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  36.14 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.51 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  44.74 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  36.56 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.59 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  39.47 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  35.8 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  33.8 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  41.1 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  37.65 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  46.67 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  33.72 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  45.61 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  39.73 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  32.88 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  38.67 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  37.65 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  35.8 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  40.38 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.88 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  51.02 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.03 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  34.38 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  39.06 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  35.94 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  31.71 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  34.52 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  33.9 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  33.9 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  36.25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  31.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  33.9 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  30 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  30.34 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  35.94 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.36 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  27.85 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  34.85 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  41.94 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  27.85 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.48 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  41.94 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  34.29 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.17 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  37.5 
 
 		 243 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  37.5 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  40.62 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  33.82 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  41.79 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  31.25 
 
 		 212 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  28.09 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  32.43 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  32.43 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  31.82 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  34.38 
 
 		 247 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  28.05 
 
 		 98 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  34.33 
 
 		 246 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.93 
 
 		 121 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  34.38 
 
 		 247 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  32.89 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  37.1 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  40.62 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  38.18 
 
 		 139 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>