61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2080 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  75 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  74.73 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  69.23 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  52.75 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.55 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  43.21 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  43.21 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  36.71 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.15 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  45.71 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  42.68 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  45.57 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  41.46 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  41.77 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  39.74 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  38.75 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  35.14 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  32.1 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  37.18 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  35.06 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  36.71 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  29.67 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  39.44 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  34.18 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  23.46 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  38.75 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  26.67 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  38.24 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  38.71 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  30.3 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  43.55 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  27.16 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  36.14 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  27.16 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  31.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  31.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  31.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  38.71 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  26.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  31.51 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  41.94 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.84 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  32.89 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  30.67 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  32.53 
 
 		 218 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  32.89 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  26.76 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.19 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>