61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0593 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  75 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  68.13 
 
 		 92 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  65.93 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.55 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.55 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  47.56 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  51.28 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  46.77 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  43.04 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  43.04 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.44 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  46.25 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  37.21 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  42.47 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  36.99 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  39.19 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  43.24 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  34.67 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  36.71 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  32.91 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.22 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  39.24 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  46.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  31.82 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  32.43 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  34.57 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  26.74 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  37.18 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  37.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  39.53 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  30.3 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  28.09 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  38.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  38.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  25 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  30.3 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  30.3 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  28.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  28.79 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  30.3 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  43.55 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  30.3 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  29.76 
 
 		 100 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  30.3 
 
 		 93 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.77 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.38 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  38.36 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.77 
 
 		 197 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>