88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07000 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  100 
 
 		 113 aa  223  5.0000000000000005e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  56.72 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  58.21 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  59.15 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  48.78 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  54.69 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  54.55 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  55.38 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  56.34 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  49.38 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  49.38 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  49.38 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  53.95 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  47.56 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  44.19 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  51.47 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  56.06 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  51.52 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  46.46 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  46.05 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.86 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  51.52 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  45 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  29.41 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  36.11 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.58 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  44.12 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  48.48 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  39.13 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  41.43 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  30.56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  32.88 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  41.18 
 
 		 205 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  50.94 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 		 197 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  30.56 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  40.26 
 
 		 205 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  41.33 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  43.64 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  35.9 
 
 		 197 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  28.95 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  49.02 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1229  protein of unknown function DUF448  50.88 
 
 		 87 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  31.08 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  36.9 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  29.73 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  39.76 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.49 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  39.76 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  38.81 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  40.48 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  37.97 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  33.78 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  32.58 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  38.27 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  37.8 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  39.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  48.48 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  27.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  34.72 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1161  protein of unknown function DUF448  50.94 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  33.72 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  33.82 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  28.99 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  35.06 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  28.99 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 249 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1101  hypothetical protein  49.06 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  31.03 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  38.46 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  35.38 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  27.54 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.71 
 
 		 105 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  32.61 
 
 		 259 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  33.82 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  42.62 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  32.86 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  32.2 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  32.5 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  35.06 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  34.62 
 
 		 200 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>