48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2490 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2490  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  54.84 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  48.94 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  54.65 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  53.01 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  44.55 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  50.55 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  48.24 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.81 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  48.42 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  48.42 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  52.17 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  48.42 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50.6 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  52.86 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3854  protein of unknown function DUF448  44.83 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal  0.0743558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  45.24 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  50 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11470  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  40.34 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0320056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  44.71 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.67 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1210  protein of unknown function DUF448  55.77 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0555311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3563  hypothetical protein  48.28 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00676266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07000  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  54.24 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.485696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1714  protein of unknown function DUF448  50.63 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  43.68 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12855  hypothetical protein  47.73 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1442  protein of unknown function DUF448  48.31 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0268949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  40.24 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.99 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  35.56 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  38.75 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  39.19 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  34.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  36 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  34.21 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1229  protein of unknown function DUF448  45.16 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  34.88 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  36.23 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1161  protein of unknown function DUF448  41.38 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.25 
 
 		 92 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>