More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2658 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.38 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  45.96 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.95 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1381  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.51 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.47 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 279 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  31.88 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  31.9 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.37 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.96 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  31.47 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  31.47 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  31.47 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  28.63 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6360  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.821284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  31.9 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.16 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  27.8 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.03 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.03 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.96 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.03 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  30.6 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  31.05 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  27.38 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.60148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.65 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.47 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  28.91 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.2 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  30.17 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  32.24 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.605397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  31.03 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  30.46 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.89 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 		 291 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  29.31 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  29.13 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  29.13 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>