More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2475 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2475  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
293 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.31 
 
 
287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  52.58 
 
 
309 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2663  thioredoxin reductase  52.45 
 
 
286 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2349  thioredoxin reductase  52.45 
 
 
286 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2134  Thioredoxin-disulfide reductase  49.13 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000266585  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  48.75 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1139  thioredoxin-disulfide reductase  46.48 
 
 
293 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.234557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  43.3 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.01 
 
 
287 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  34.45 
 
 
304 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.47 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  33.01 
 
 
304 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  35.22 
 
 
304 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
312 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  31.25 
 
 
318 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  30.92 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  30.92 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  30.92 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  30.92 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  30.92 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  30.59 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  30.92 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  29.64 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  30.92 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  31.68 
 
 
308 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  32.81 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  32.78 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  30.92 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  31.37 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  34.2 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  30.72 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  34.43 
 
 
306 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  29.93 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  32.34 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  30.59 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  32.89 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  31.89 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  32.47 
 
 
323 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  30.03 
 
 
317 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 
551 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  34.09 
 
 
316 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.99 
 
 
548 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  32.13 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  30.72 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.21 
 
 
579 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  29.7 
 
 
317 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  30.69 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  30.07 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  31.23 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  32.01 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  32.34 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  31 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  32.14 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  33.55 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  29.41 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  31.51 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  32.05 
 
 
316 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  31.56 
 
 
292 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  30.07 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  30.19 
 
 
309 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  33.23 
 
 
318 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  32.67 
 
 
306 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  32.57 
 
 
395 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  31.73 
 
 
316 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  31.61 
 
 
316 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  33.12 
 
 
340 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.46 
 
 
547 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  28.48 
 
 
309 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  31.8 
 
 
312 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  33.67 
 
 
325 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  29.84 
 
 
340 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  30.38 
 
 
297 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  33.12 
 
 
340 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.05 
 
 
515 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  32.14 
 
 
320 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  31.56 
 
 
316 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  33.12 
 
 
334 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  33.44 
 
 
317 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  33.12 
 
 
322 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  30.67 
 
 
299 aa  122  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.85 
 
 
519 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  30.67 
 
 
318 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  32.15 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  29.61 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  29.14 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  31.94 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  29.61 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  32.69 
 
 
321 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  32.39 
 
 
327 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  31.54 
 
 
305 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  33.44 
 
 
317 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.97 
 
 
509 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  34.11 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  28.99 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  30.43 
 
 
391 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  32.72 
 
 
343 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>