More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2663 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2663  thioredoxin reductase  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2349  thioredoxin reductase  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2475  Thioredoxin-disulfide reductase  52.45 
 
 
293 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.9 
 
 
287 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.06 
 
 
287 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2134  Thioredoxin-disulfide reductase  48.75 
 
 
290 aa  278  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000266585  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  48.76 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  47.72 
 
 
287 aa  265  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1139  thioredoxin-disulfide reductase  43.01 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.234557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  44.72 
 
 
309 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.67 
 
 
306 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  37.04 
 
 
304 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  34.65 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  33.44 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  32.46 
 
 
308 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  32.14 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.23 
 
 
316 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
312 aa  135  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.25 
 
 
551 aa  135  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.32 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  31.7 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  34.55 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.01 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  31.05 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.01 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  29.18 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  31.37 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  31.05 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  31.94 
 
 
318 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  31.94 
 
 
318 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  31.94 
 
 
318 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 
318 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  31.94 
 
 
318 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  31.58 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  31.58 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  31.58 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  34.43 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  30.42 
 
 
315 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.66 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  31.25 
 
 
550 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  32.11 
 
 
395 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.17 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.68 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.74 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  30.28 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  32.35 
 
 
311 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  32.35 
 
 
311 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  31.48 
 
 
310 aa  126  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.67 
 
 
579 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  34.2 
 
 
310 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.03 
 
 
318 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.64 
 
 
301 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  30.16 
 
 
310 aa  124  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  32.11 
 
 
311 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32.23 
 
 
391 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  32.03 
 
 
321 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  33.23 
 
 
312 aa  122  7e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  29.7 
 
 
318 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  30.9 
 
 
336 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.79 
 
 
383 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  30.59 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  34.39 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  30.52 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
325 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  32.15 
 
 
332 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 
548 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  31.72 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  32.05 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  29.28 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  31.09 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  30.39 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  31.8 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  32.46 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  32.03 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  30.23 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  32.48 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  33.23 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  30.23 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  28.95 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  30.23 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  30.35 
 
 
359 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  31.15 
 
 
304 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  33.9 
 
 
297 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  29.1 
 
 
299 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
320 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.31 
 
 
312 aa  116  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  27.96 
 
 
303 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  31.37 
 
 
316 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  29.41 
 
 
330 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  29.9 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  30.52 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  31.83 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  29.32 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  30.1 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>