40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2560 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  33.74 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.35 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.2 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.62 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.82 
 
 		 698 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.73 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.73 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1054 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  23.49 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1078 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.29 
 
 		 909 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.35 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1044 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1021 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 999 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  27.53 
 
 		 661 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  30 
 
 		 1220 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1063 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  28.23 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.68 
 
 		 694 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1147 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 931 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  30.73 
 
 		 780 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  26.97 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.4 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  38.64 
 
 		 557 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 757 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1032 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  31.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1082 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  27.68 
 
 		 1084 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  27.31 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  33.79 
 
 		 911 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1048 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  31.33 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1117 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  29.22 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.86 
 
 		 597 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>